Metody mikrobiální diagnostiky

Studentům budou poskytnuty podrobné informace o metodách pro diagnostiku medicínsky významných virových a bakteriálních patogenů s důrazem na vysvětlení mechanismu metod a na jejich aplikaci. Obsah přednášky: (1) Úvod do předmětu, klasifikace diagnostických metod, metody oběru a zpracování klinických vzorků, (2) Kultivační bakteriologické metody, klasické typizační postupy, biochemické metody druhové identifikace bakterií, stanovení citlivosti na antibiotika, fagotypizace (3) Kultivační virologické metody, reportérové virové systémy a animální modely, (4) Mikroskopické techniky (světelná a elektronová mikroskopie), barvicí mikrobiologické postupy, (5) Molekulárně-biologické metody v diagnostice mikroorganismů (hybridizační techniky, restrikční analýza, sekvenační metody, polymerázová řetězová reakce (PCR), kvantitativní PCR, elektroforéza nukleových kyselin, genotypizace), (6) Imunologické diagnostické metody (využití polyklonálních, monoklonálncíh a rekombinantních protilátek, aglutinační a imunoprecipitační techniky, imunoelektroforéza, imunoanalytické testy (ELISA, RIA, FIA, CLIA), dip-stick techniky a další rychlé metody pro diagnostiku mikroorganismů), (7) Metody založené na biosenzorech, elektrochemické, optické a piezoelektrické senzory, techonologie mikročipů pro diagnostiku mikroorganismů (8) Mikrobiální diagnostické metody založené na separaci a identifikaci proteinů (elektroforéza proteinů a blotovací techniky), (9) Základy hmotnostní spektrometrie, využití MALDI-TOF MS a jiných ionizačních technik pro diagnostiku.